Egy tömbös világban fegyveres konfliktus tört ki a terroristák és a rendőrség között az egyik városban. Véres háború kezdődött, amelyben mindkét fél hatalmas veszteségeket szenved. Meghívjuk Önt a Pixel Gun Apocalypse játékba, hogy csatlakozzon az egyik félhez. A játék elején felkérik, hogy válassza ki, melyik oldalon szeretne játszani. Dönts tudatosan, és ha barátaiddal játszol, egy csapatot alkothatsz. A játék kezdete után átkerülsz arra a helyre, ahol különböző épületek találhatók. Hősöd fogakig lesz felfegyverkezve, ezért válassz kedvedre való fegyvert. Ezt követően lépjen előre csapatának játékosaival, és keresse meg az ellenséget. Miután megtalálta, lépjen tűzkapcsolatba, és szánalom nélkül pusztítsa el őket. Az nyeri a játékot, aki a legtöbb ellenséget ölte meg.